港航与船舶工程实验中心下属港航工程实验室及船舶工程实验室。其中港航工程实验室成立于2002年，该实验室依托于本学院港口航道与海岸工程专业，由土力学实验室、水力学实验室、工程地质实验室、工程测量实验室、建筑材料实验室、港航综合实验室、港航模拟实验室等基础实验室组成；目前实验室总面积约为1000平方米，设备总资产约420万元。实验室拥有土工静动三轴仪、混凝土冻融实验箱、土工万能试验机、SWS地质勘探仪、全站仪、电子经纬仪、水力学自制流槽、水力学自循环系列试验仪等实验设备，以及港口与航道工程仿真平台、易工港口工程设计软件、大型分析及设计软件CAE软件ABAQUS、CFD软件FLUENT等数值仿真软件。
船舶实验室成立于2012年，该实验室依托于本学院船舶与海洋工程专业，下属船舶工程设计实验室。目前实验室总面积145平方米，设备总资产约300元。实验室拥有颗粒流程序PFC、船舶性能分析软件shipflow、船舶结构有限元分析软件Patran、船舶波浪载荷计算软件Hydrostar、船舶三维建模软件Soliwokes等虚拟仿真软件。
实验中心由2位专职实验教师组成。中心面向全校，服务于港口航道与海岸工程，船舶与海洋工程、交通工程、环境工程、安全工程等专业，每学年约承担约650人的本科教学实验，100人的本科教学实习，100人的本科毕业设计上机，学时人数约为10340人时数。与此同时也为本科学生科创、研究生研究型实验，教师科研的开展提供了平台。
实验中心本着立足于基础，结合新技术改良的理念，正逐渐摸索与推广实践与虚拟相结合的教学、实验方法。
水力学实验室
水力学自制流槽
土力学固结实验室
土工静动三轴仪
模拟实验室（易工港航设计软件）
工程测量水准仪、电子经纬仪、全站仪
钢筋混凝土结构实物模型